ĐỊNH DANH CÁC CHỦNG VI KHUẨN MỌC TRÊN MÔI TRƯỜNG THIOSULPHATE CITRATE BILE SALT SUCROSE (TCBS)

Tóm tắt

Tóm tắt: Môi trường Thiosulphate-citrate-bile-salt-sucrose (TCBS) đã sử dụng là môi trường chọn lọc cho các dòng vi khuẩn Vibrio spp. Tuy nhiên tính chọn lọc của môi trường bị nghi ngờ do các dòng vi khuẩn khác được phát hiện mọc trên TCBS. Mục đích của nghiên cứu là sử dụng đặc điểm hình thái khuẩn lạc, tế bào vi khuẩn kết hợp với kết quả giải trình tự gen 16S-rRNA của vi khuẩn để định danh chính xác các chủng mọc trên TCBS. Kết quả cho thấy, trong số 144 chủng phân lập từ các nguồn mẫu khác nhau cho thấy 18 chủng thuộc nhóm Gram (+) và có các nhóm khuẩn lạc màu xanh, vàng, trắng. Kết quả giải trình tự 122 trong tổng số 144 chuỗi trình tự 16S rRNA của các dòng phân lập trên TCBS được xác định ở mức tương đồng ≥99% và ≥ 97% so với các trình tự tham khảo trên ngân hàng gen NCBI. Trong 122 chủng được định danh, có 43 chủng (35.2%) không phải Vibrio spp. bao gồm Aeromonas, Staphilococcus, Pseudomonas và Bacillus. Kết quả nghiên cứu khẳng định không nên sử dụng số lượng khuẩn lạc mọc trên môi trường TCBS để định lượng vi khuẩn Vibrio spp. trong môi trường và sản phẩm thủy sản..
Keywords: Vibrio, 16S-rDNA, TCBS, SSDE, Isolation, PCR, sequencing